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Discovery Studio电脑版

一款分子建模软件

Discovery Studio 2021是一款功能非常强大的分子建模软件,该软件拥有的功能十分强大,支持模型构型、模型分析、科学应用、脚本编写、图像分析、药理基团、蛋白质建模、RL互动、序列分析、排序、模拟以及X射线等多种的功能,但是其主要的功能就是让用户能够在编辑化学教材的时候拥有超多的模型和图纸设计方案。它可以够帮助用户轻松进行各种分子建模的工作,甚至还有效的提升了用户的角膜效率,从而让分子的研究更加的高效。使用它,用户可以通过高质量的图形、多年专业验证的技术以及集成的环境,从而为用户提供实验数据保存、管理与专业水准的建模,这样就可以提高我们用户在建模上的效率。除此之外,Discovery Studio软件在化学方面,是可以通过数据建立分子模型,甚至还可以分析多种实验以及物体的结构,完全是支持生成模型输出到打印机上;然后在生物分析方面,也是支持将不同的基因序列放到软件上进行计算的,并且还可以以对比不同序列的变化,从而从而知道蛋白质、DNA的实验结果。

Discovery Studio 2021安装步骤:

1、在本站下载解压文件,解压得到Discovery Studio 2021原程序和补丁文件夹;

2、选择“DS45Client.exe”开始安装软件,单击“下一步”;

3、选择自己的安装路径,

4、点击安装

5、安装中,请稍候

6、将补丁文件复制到安装路径

7、以上就是Discovery Studio的全部安装教程,大家可以免费使用。

Discovery Studio 2021使用方法

1、双击打开软件,如下图

2、进入软件,显示很多示例文件,这里可以点击第一个Protein Structure蛋白质结构查看

3、如图所示,这里就是蛋白质的编辑样式,如果你需要自己设计,可以从化学界面上找到模型

4、点击Multiple sequence alignment功能,可以将您的多序列比对

5、提示一些关于DNA的子项目,可以点击DNA-Single Strand查看链接,也可以查看不同的分子样式

6、点击Chemistry可以查看软件的化学结构,可以分析立体化学模型

软件功能

1、图形选项卡-图形视图显示样式对话框

“图形视图显示样式”对话框上的“图形”选项卡允许您为当前“分子窗口”设置常规图形属性。该选项卡始终可用,并且在保存文件时,此处指定的设置将与其余数据一起保存。该窗口中的设置是通过“分子窗口” |“分子窗口”访问的全局应用程序设置的子集。图形首选项页面。

2、投影

这些选项使您可以设置两种不同投影模式的分子显示:

正交投影:正交投影可产生一个视图,在该视图中,对象与观察者之间的距离无视其大小相同。正射投影通常用于工程图形中,并具有更高的精度。

透视图:透视图投影会产生一个视图,其中距离观察者较远的对象看起来比靠近观察者的对象小。这类似于人眼观察世界和照相机产生照片的方式。透视投影通常通过强调模型的深度而非大小来提供更真实的模型表示。

角度:透视角度控制透视投影中出现的缩短距离。较小的角度可减小透视度,而较大的角度可增大透视度。角度限制为1到120度之间的值。默认值为45.00°。

3、质量

质量设置控制用于显示蛋白质和DNA / RNA的3维对象的粗糙度。较低的质量设置将通过增加粗糙度来改善渲染性能。较高的质量设置可以改善视觉外观。

对于常规使用,请选择能够最佳组合性能和质量的设置。如果要导出图像,请选择“超高”以获得最佳质量。

4、背景颜色

这将打开“选择颜色”对话框,您可以在其中选择当前窗口的背景色。

5、其他选择

线宽:控制用于以线显示样式和单元格边界渲染对象(例如分子)的线的粗细。

深度提示:打开时,距离观察者较远的对象会逐渐融合到背景中,而靠近观察者的对象将以完整,明亮的颜色显示。通过更明亮地照亮附近的物体,而更远的物体逐渐消失在黑暗中,此功能可以更好地感觉景深。关闭深度提示后,无论物体颜色与观察者的距离有多远,物体的颜色都将充满而明亮。

6、原子选项卡-“图形视图显示样式”对话框

“ 图形视图显示样式”对话框上的“ 原子”选项卡控制原子和键的图形表示。

7、展示风格

无:将选定的原子空白,使其不显示在屏幕上。您可以使用这种样式来简化复杂的分子,方法是仅显示感兴趣的原子,或者在将蛋白质显示为条带时隐藏原子。

线:使用传统的线框显示器显示原子。未结合的原子显示为插孔。

摇杆:使用实心圆柱体显示粘结。非化学键原子显示为千斤顶作为一个 线风格。的棒尺寸参数改变棒的厚度。

球和棒:使用圆柱体来描述键,原子来描述球。使用“ 球尺寸”和“ 杆尺寸”参数确定 球和杆的尺寸。

缩放的球和棒:使用圆柱体和原子进行键合,并使用缩放到范德华(VDW)半径的球。使用“ 球尺寸”和“ 杆尺寸”参数确定球和杆的尺寸。您可以通过选择化学|自定义每个元素的默认VDW半径。菜单栏中的元素属性...命令。

CPK:显示大小与范德华(VDW)半径相同的球。该CPK规模设定乘以VDW半径由给定因素。您可以使用化学|自定义每个元素的默认VDW半径。元素属性...命令。

多面体:显示原子周围的配位多面体。这种样式主要用于材料和无机分子。该多面体风格创建具有四个或更多债券的原子多面体。对聚合物的最终效果类似于链中的珠子。少于四个键的原子显示为线,不显示没有键的原子。

8、染色

着色方式:您可以通过多种方式为原子着色。“ 颜色依据”列表具有多种预定义的配色方案,包括:

元素:使用为其元素定义的颜色为每个原子着色。您可以通过选择化学|更改基本元素的颜色。菜单栏中的元素属性...命令。

父色:通过包含原子的父对象的颜色为每个原子着色。例如,如果氨基酸中包含原子,则该原子被氨基酸的颜色着色。

分子颜色:通过原子所属的分子的颜色为每个原子着色。

局部电荷:通过其局部电荷为每个原子着色。颜色是从红色(带负电荷)到蓝色(带正电荷)的渐变中获取的。

<其他>:根据在分子上计算出的原子和分子属性以及模型的层次结构,许多其他配色方案会自动添加到可用选项中。这些配色方案由包含原子的层次结构中的分子对象命名,颜色基于模型中这些对象的数量。例如, 如果加载的蛋白质包含多条链,则将Molecule,AminoAcidChain和AminoAcid方案添加到颜色选项中。如果您使用分子方案,则分子中的所有原子都是单一颜色(通常在文档中只有一个分子)。如果您通过AminoAcidChain着色,一条链中的所有原子都着色为一种颜色,而第二条链中的所有原子均着色为另一种颜色。

注意。数据表中包含数字的任何列都可以用作颜色标准。

颜色...:此按钮将启动“ 颜色映射”对话框。

自定义:选择单选按钮,然后单击颜色框以显示“ 选择颜色”对话框。定义颜色后,单击“ 应用”按钮或“ 确定”按钮,将自定义颜色应用于选定的原子。

仅碳原子:选中此框可将自定义颜色仅应用于碳原子。

9、更多控制

显示债券定单:此复选框控制多个债券的显示方式是否与单个债券不同。该选项影响Line,Stick和Ball and Stick的显示样式。

球尺寸,棒尺寸,CPK比例:使用这些字段可自定义比例适当的功能。

10、蛋白质选项卡-图形视图显示样式对话框

该蛋白质的图形视图显示样式对话框中的选项卡允许您控制的氨基酸和氨基酸链的表示图形视图。

有几种可用的表示方式,突出显示了蛋白质分子的关键特征,以允许检查更高级别的结构信息。

11、其他控制

等值线:更改实体,三角形网格和四边形网格等值面显示的几何形状。

线宽:当等值面显示为“ 三角形网格”或“ 四边形网格”显示时,控制线的粗细 。

直方图:显示文件中包含的等值面数据的范围。移动直方图左侧和右侧的两个青色滑块,以控制光谱的分布。左侧滑块下方的值被分配为最左侧的颜色。右滑块上方的值被分配为最右边的颜色。如果选中了“ 超出范围限制”选项,则这些值将不会显示在“分子窗口”中。

显示框:选中此选项将导致显示等值面的边界框。

光谱:包含可应用于“ 体积 等值面”显示的各种光谱。所选光谱显示在直方图的底部。

带:频谱控制是否显示在2, 4,8,16,32,64,或128颜色的条带。默认值为32。

透明度:控制体积等值面数据的透明度。向左滑动控件,使等值面显示更加透明。向右滑动控件,使等值面显示更加不透明。

剪辑超出范围:当直方图中的值受到限制时,控制等值面信息的显示。取消选中此框时,超出范围的值分别分配为最左侧和最右侧。选中此框时,根本不会显示超出范围的值。

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